En général un trop plein de bactéries est du à un excès de phosphate dans l'eau...
De manière général, pour lutter contre tout type d'algues, ajouter des plante est un bon moyen.
J'utilise une technique similaire mais de façon temporaire : j'ai un pothos placé dans un pot avec uniquement de l'eau, et quand j'ai besoin de lutter contre les algues dans un aqua je le place dedans, avec ses racines immergées et le reste en dehors. En quelques jours/semaines, le pothos a vite fait d'absorber les excès de nitrates/phosphate. Une sorte de filtre naturel.
Sinon, contre les algues classiques (dépôt sur vitres, plantes, décor), les Neritina sont très efficaces, à raison d'un individu pour 30/40L.